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Fabiano Eler dos Santos nasceu em Linhares, Espírito Santo, em 19 de novembro de 1977. Iniciou sua carreira profissional no Santos Futebol Clube em 1997, onde permaneceu até 2002.
Durante sua passagem pelo Santos, Fabiano Eler se destacou como um zagueiro confiável e versátil. Sua habilidade de atuar tanto como zagueiro central quanto lateral-direito o tornou um jogador valioso para o time.
Com o Santos, Fabiano Eler conquistou o Campeonato Brasileiro Série A em 2002. Ele também foi vice-campeão da Copa Libertadores da América em 2003.
Fabiano Eler representou a Seleção Brasileira Sub-20 no Campeonato Mundial Juvenil da FIFA em 1997. Ele também foi convocado para a Seleção Brasileira principal em 2003, mas não chegou a atuar.
Fabiano Eler se aposentou do futebol profissional em 2012, após passagens por diversos clubes brasileiros, incluindo Cruzeiro, Atlético Mineiro e Vitória.